Proces operacyjny zagęszczacza zazwyczaj rozpoczyna się od urządzenia do dystrybucji surowca, które zapewnia równomierne rozprowadzenie szlamu w całym zbiorniku, zapobiegając w ten sposób zlokalizowanym obszarom nadmiernego stężenia lub turbulentnego przepływu. Na tym etapie cząstki stałe zaczynają powoli osiadać pod wpływem grawitacji, podczas gdy klarowna ciecz stopniowo oddziela się i unosi, tworząc warstwową-stałą strukturę cieczy. Aby zapewnić optymalną skuteczność osadzania, prędkość podawania musi być utrzymywana w odpowiednim zakresie: nie może być zbyt duża, aby spowodować wyrzucenie cząstek w górnych warstwach do góry, ani tak mała, aby zmniejszyć wydajność przetwarzania urządzenia.
W fazie zagęszczania gromadzące się na dnie cząstki stałe tworzą zagęszczoną warstwę. Zgarniaki lub mieszadła obracają się powoli wzdłuż dna zbiornika, równomiernie transportując zagęszczony materiał w kierunku otworu wylotowego, jednocześnie zapobiegając tworzeniu się stref zastoju na dnie. Klarowna ciecz w górnej warstwie przepływa przez jaz przelewowy do rynny zbiorczej, uzyskując w ten sposób skuteczną separację cieczy-ciała stałego. Operatorzy mogą kontrolować szybkość zagęszczania i końcowe stężenie szlamu, dostosowując parametry, takie jak prędkość obrotowa zgarniacza, poziom cieczy i szybkość podawania zagęszczacza, zapewniając wysoką wydajność urządzenia przy jednoczesnym zachowaniu jednorodności szlamu.
Zagęszczony szlam na dnie jest w sposób ciągły odprowadzany przez zgarniaki i przekazywany do następnego etapu procesu,-takiego jak usuwanie odpadów poflotacyjnych, filtracja lub pompowanie do zbiornika magazynującego gnojowicę. Jednocześnie można odzyskać lub usunąć klarowną ciecz przelewową z górnej warstwy zagęszczacza. Cały proces zazwyczaj przebiega w sposób ciągły; poprzez cykliczną sekwencję ciągłego podawania, osadzania, zagęszczania i rozładowywania, sprzęt osiąga efektywne stężenie cząstek stałych w zawiesinie i oddzielanie klarownej fazy ciekłej. Co więcej, optymalizując parametry operacyjne i rozsądnie dodając flokulanty, można przyspieszyć osadzanie i zmniejszyć zmętnienie klarownej cieczy, spełniając w ten sposób specyficzne wymagania różnych procesów produkcyjnych.

